萤火虫的栖息地选择严格依赖环境湿度、植被覆盖及水质条件。陆生种类多栖息于山区落叶层、灌木丛或农田边缘，例如中国南方的竹林、茶园因湿度适宜、腐殖质丰富，成为优势种群的栖息地。水生种类则偏好静水或缓流区域，如稻田、池塘及溪流，其幼虫需附着于水生植物或泥沙表面，以螺类、蚯蚓为食。半水生种类如某些窗萤属物种，幼虫栖息于溪流旁潮湿岩壁，成虫则在夜间飞至林间空地求偶。

人类活动对萤火虫栖息地构成严重威胁。城市化导致自然植被减少，光污染干扰其生物钟及求偶行为；农药使用直接毒杀幼虫，破坏食物链；水体污染则使水生种类丧失繁殖场所。例如，中国长江流域部分湿地因围垦造田，萤火虫种群数量下降超80%。保护措施需聚焦栖息地修复，如建立生态廊道连接破碎化生境、推广有机农业减少化学污染、控制夜间灯光强度等。此外，公众可通过参与萤火虫观测活动提升保护意识，避免直接捕捉或使用闪光灯拍摄。